Em Marvel's Wolverine, apesar da presença de mutantes conhecidos, os X-Men não existem. O jogo se concentra em Logan como um ex-membro da Equipe X, uma unidade secreta que inclui personagens como Dentes-de-Sabre e Lady Letal. Embora Jean Grey esteja no jogo, ela não é parte dos X-Men.
O diretor narrativo Walt Williams explicou em entrevista que a Insomniac decidiu afastar os X-Men para mostrar que os mutantes vivem à margem da sociedade, sem um lugar seguro. Para Williams, Wolverine é o personagem ideal para representar essa marginalização. Ele afirmou que a Equipe X é canônica, sendo a primeira equipe de Logan, formada nos anos 70 para missões secretas.
Williams enfatizou que, ao contrário dos super-heróis que são celebrados, os mutantes são outsiders, e essa característica não tem sido muito explorada nas narrativas atuais. Ele destacou que, se os X-Men existissem no jogo, isso implicaria um espaço seguro para eles, o que não reflete a realidade difícil e assustadora da vida de um mutante.
Além disso, a ausência dos X-Men permite que Logan e Jean Grey explorem seu relacionamento romântico sem a presença de Scott Summers, o Ciclope. Williams confirmou que não haverá um triângulo amoroso entre os três, focando apenas no vínculo entre Logan e Jean.
Ao optar por não incluir os X-Men, a Insomniac busca criar uma narrativa mais centrada em Wolverine. Isso pode abrir caminho para uma futura exploração mais ampla do universo dos X-Men em outros jogos.
